Molecular Characterization of Scarlet and Gboma Eggplants Based on Single Nucleotide Polymorphisms

  • Dionís Borrá s Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Mariola Plazas Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Isabel Andáºjar Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Pietro Gramazio Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Francisco Javier Herraiz Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Jaime Prohens Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
  • Santiago Vilanova Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
Keywords: genetic diversity, high resolution melting, Solanum spp., SNPs, wild relatives

Abstract

The common eggplant (Solanum melongena) is one of the most economical important cultivars. The relationship between eggplant and it the wild relatives has been controversial. The domestication of the cultivated species has resulted in a narrow genetic base, and this difficults further improvements. Here we have characterized 48 accessions belonging to the cultivated scarlet eggplant (S. aethiopicum) and it wild ancestor (S. anguivi), the cultivated gboma eggplant (S. macrocarpon) and its wild ancestor (S.dasyphyllum), including also one accession of cultivated eggplant and one of its wild ancestor (S. incanum) using 39 single nucleotide polymorphism (SNP) markers. A total of 82 alleles were detected with an average of 2.34 alleles/locus. A good differentiation between the three groups corresponding to common, scarlet and gboma eggplants was obtained with a PCoA analysis. These results are of interest for the enhancement of genetic resources of eggplants.

Author Biography

Jaime Prohens, Institut de Conservació i Millora de l’Agrodiversitat Valenciana. Universitat Politècnica de València, Spain.
Biotechnology Department (Genetics)
Published
2015-11-27